まず、既存のpcmanfm.confファイルをセーブしておいて、上の方にある3行を1から0に修正する。
$ cd ~/.config/pcmanfm/LXDE-pi
$ rsync -av /etc/xdg/pcmanfm/LXDE-pi/pcmanfm.confや .
ファイルの用意ができましたから実際に修正します。
[volume]
mount_on_startup=0
mount_removable=0
autorun=0
volumeセクションにある項目の値を0に修正しています。その後再起動で反映されます。